Replication Data for: Microbiome Profiling from Fecal Immunochemical Test Reveals Microbial Signatures with Potential for Colorectal Cancer Screening

DOI

16S rRNA metabarcoding from FIT positive samples (raw sequence reads)

Els arxius .sra d’aquest conjunt de dades contenen les lectures crues ("row sequence reads") obtingudes per seqüenciació de la regió V3-V4 del gen 16S rRNA, a partir d’ADN extret directament de mostres FIT positives recollides en el marc del programa de cribratge poblacional de càncer colorectal de Catalunya. L’objectiu de l'estudi era caracteritzar el microbioma intestinal i identificar biomarcadors microbians relacionats amb la presència de lesions colorectals detectades mitjançant colonoscòpia.

Aquest conjunt de dades també està disponible a l’arxiu de lectures de seqüències del NCBI (Sequence Read Archive, SRA) sota l’identificador de BioProject PRJNA792716 (URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA792716/)

Identifier
DOI https://doi.org/10.34810/data2300
Related Identifier IsSupplementTo https://doi.org/10.3390/cancers15010120
Metadata Access https://dataverse.csuc.cat/oai?verb=GetRecord&metadataPrefix=oai_datacite&identifier=doi:10.34810/data2300
Provenance
Creator Khannous Lleiffe, Olfat (ORCID: 0000-0003-0325-755X)
Publisher CORA.Repositori de Dades de Recerca
Contributor Rubinat-Ripoll, Laura; Institut de Recerca Biomèdica
Publication Year 2025
Rights CC0 1.0; info:eu-repo/semantics/openAccess; http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0
OpenAccess true
Contact Rubinat-Ripoll, Laura (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona))
Representation
Resource Type Clinical data; Dataset
Format application/x-gzip; text/plain; text/comma-separated-values
Size 2418482087; 1200; 2461706539; 2425071648; 2752101042; 2721059398; 2719182121; 2742835105; 1992648654; 2683225259; 2949081810; 2852332098; 2332721703; 2491810640; 2759075331; 2592855309; 2554851692; 2409831359; 2529447056; 2803623788; 2602270740; 2442454540; 2562090371; 2415154642; 2426632682; 2687634014; 2434344900; 2637202916; 2206521349; 1010654985; 528; 23860; 34128; 2514099
Version 1.0
Discipline Life Sciences; Medicine