The dataset results from a 10-year experiment conducted on sessile oak (Quercus petraea) both in a provenance plantation (Sillegny, NE France) and in a network of mature stands along a wide altitudinal gradient (Pyrénées, SW France). The aim was to assess the use of seasonal variations in the fraction of light intercepted by the tree canopy to (1) date the successive events of leafing in spring and leaf senescence in autumn, and (2) monitor environmental gradients in leaf phenology, such as those induced by altitude.
The fraction of radiation intercepted (FiR) by the canopy of each studied tree population was estimated from continuous measurements of the radiation transmitted through the tree crowns and the radiation incident above the canopy. This was done in the wavelengths of photosynthetically active radiation (PAR) and in the blue and green spectral bands using two types of sensors, quantum sensors and photodiodes, respectively. In a given spectral band, FiR =1- Transmittance, where Transmittance= transmitted radiation / incident radiation. The time series of FiR have been produced with a daily frequency year by year. The dataset includes all the time series produced, from the raw measurements to the annual series of daily FiR.
Temporal variations in FiR were smoothed to different degrees to best capture seasonal transitions using several models: non-parametric smoothers (Spline, Whittaker) and a parametric model (Gompertz). Metrics were extracted that systematically date variations in the modelled annual trajectory during leafing and senescence. The dataset includes the metrics produced for each model for each population, year by year.
The metrics were evaluated by comparing them with visual phenological observations in the field, pooled by population. These data are also included.
Le jeu de données résulte d'une expérience de 10 ans menée sur le chêne sessile (Quercus petraea) à la fois dans une plantation de provenance (Sillegny, NE France) et dans un réseau de peuplements matures le long d'un large gradient altitudinal (Pyrénées, SO France). L'objectif était d'évaluer l'utilisation des variations saisonnières de la fraction de lumière interceptée par le couvert pour (1) dater les stades successifs de feuillaison au printemps et de sénescence des feuilles en automne, et (2) suivre l’évolution des gradients environnementaux de la phénologie des feuilles, tels que ceux induits par l'altitude.
La fraction de rayonnement interceptée (FiR) par chaque population d'arbres étudiée a été estimée à partir de mesures continues du rayonnement transmis à travers les houppiers et du rayonnement incident au-dessus de la canopée. Ces mesures ont été effectuées dans les longueurs d'onde du rayonnement photosynthétiquement actif (PAR) et dans les bandes spectrales bleue et verte à l'aide de capteurs quantiques et de photodiodes, respectivement. Dans une bande spectrale donnée, FiR =1- Transmittance, où Transmittance = rayonnement transmis / rayonnement incident. Les séries temporelles de FiR ont été produites avec une fréquence quotidienne, année par année. Le jeu de données comprend toutes les séries temporelles produites, depuis les mesures brutes jusqu'aux séries annuelles de FiR quotidien.
Les variations temporelles de FiR ont été lissées à différents degrés à l'aide de différents modèles pour en capter au mieux les transitions saisonnières: des lisseurs non paramétriques (Spline, Whittaker) et un modèle paramétrique (Gompertz). Des métriques ont été extraites qui datent systématiquement les variations de la trajectoire annuelle modélisée, au cours de la feuillaison et de la sénescence. Le jeu de données comprend les métriques produites pour chaque modèle pour chaque population, année par année.
L'évaluation des métriques était fondée sur une comparaison avec des observations phénologiques visuelles sur le terrain, agrégées par population. Ces données sont également fournies.
R, 4.0.5